Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms