Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tbr1Q64336 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms