Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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