Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Defa17Q64016 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Defa17Q64016 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Defa17Q64016 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms