Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a5Q63ZW6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms