Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CochQ62507 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CochQ62507 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CochQ62507 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CochQ62507 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CochQ62507 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CochQ62507 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CochQ62507 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CochQ62507 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CochQ62507 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CochQ62507 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CochQ62507 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CochQ62507 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms