Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms