Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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