Protein–RNA interactions for Protein: Q62440

Tle1, Transducin-like enhancer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle1Q62440 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tle1Q62440 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tle1Q62440 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms