Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms