Protein–RNA interactions for Protein: Q62230

Siglec1, Sialoadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siglec1Q62230 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siglec1Q62230 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siglec1Q62230 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms