Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpaQ62189 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms