Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhocQ62159 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhocQ62159 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhocQ62159 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RhocQ62159 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms