Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms