Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrn1Q61809 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn1Q61809 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms