Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ifi47Q61635 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ifi47Q61635 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ifi47Q61635 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Ifi47Q61635 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Ifi47Q61635 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Ifi47Q61635 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ifi47Q61635 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ifi47Q61635 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms