Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad21Q61550 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms