Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MslnQ61468 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MslnQ61468 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MslnQ61468 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MslnQ61468 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MslnQ61468 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MslnQ61468 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MslnQ61468 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MslnQ61468 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MslnQ61468 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MslnQ61468 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MslnQ61468 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms