Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms