Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms