Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms