Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms