Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms