Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms