Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms