Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms