Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SkiQ60698 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms