Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms