Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms