Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms