Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sema5bQ60519 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms