Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a3Q5XF89 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a3Q5XF89 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a3Q5XF89 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a3Q5XF89 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a3Q5XF89 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a3Q5XF89 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a3Q5XF89 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a3Q5XF89 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp13a3Q5XF89 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms