Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms