Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gprasp1Q5U4C1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms