Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms