Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms