Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf215Q5SPX3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms