Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg7Q5RJH6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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