Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

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Length 794 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms