Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trdv4Q5R1A3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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