Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms