Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim58Q5NCC9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms