Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms