Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clhc1Q5M6W3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms