Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36l3Q5ISE2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36l3Q5ISE2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36l3Q5ISE2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36l3Q5ISE2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36l3Q5ISE2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36l3Q5ISE2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36l3Q5ISE2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36l3Q5ISE2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp36l3Q5ISE2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms