Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm3Q5F4S9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm3Q5F4S9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm3Q5F4S9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm3Q5F4S9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm3Q5F4S9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm3Q5F4S9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm3Q5F4S9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm3Q5F4S9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm3Q5F4S9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm3Q5F4S9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm3Q5F4S9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm3Q5F4S9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm3Q5F4S9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm3Q5F4S9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm3Q5F4S9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm3Q5F4S9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm3Q5F4S9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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