Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Nlrc3Q5DU56 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Nlrc3Q5DU56 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Nlrc3Q5DU56 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Nlrc3Q5DU56 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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