Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms