Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Spag9Q58A65 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spag9Q58A65 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spag9Q58A65 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spag9Q58A65 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spag9Q58A65 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spag9Q58A65 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spag9Q58A65 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spag9Q58A65 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spag9Q58A65 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Spag9Q58A65 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Spag9Q58A65 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Spag9Q58A65 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Spag9Q58A65 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spag9Q58A65 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spag9Q58A65 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms