Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms